Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S0

NANOG, Homeobox protein NANOG, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGQ9H9S0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NANOGQ9H9S0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NANOGQ9H9S0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NANOGQ9H9S0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NANOGQ9H9S0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms