Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CLSTN2Q9H4D0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLSTN2Q9H4D0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLSTN2Q9H4D0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLSTN2Q9H4D0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSTN2Q9H4D0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSTN2Q9H4D0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSTN2Q9H4D0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLSTN2Q9H4D0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLSTN2Q9H4D0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLSTN2Q9H4D0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLSTN2Q9H4D0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLSTN2Q9H4D0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CLSTN2Q9H4D0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLSTN2Q9H4D0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLSTN2Q9H4D0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLSTN2Q9H4D0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLSTN2Q9H4D0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLSTN2Q9H4D0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLSTN2Q9H4D0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLSTN2Q9H4D0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLSTN2Q9H4D0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSTN2Q9H4D0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSTN2Q9H4D0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSTN2Q9H4D0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSTN2Q9H4D0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSTN2Q9H4D0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLSTN2Q9H4D0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSTN2Q9H4D0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSTN2Q9H4D0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSTN2Q9H4D0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSTN2Q9H4D0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSTN2Q9H4D0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSTN2Q9H4D0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLSTN2Q9H4D0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLSTN2Q9H4D0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLSTN2Q9H4D0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLSTN2Q9H4D0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLSTN2Q9H4D0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLSTN2Q9H4D0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLSTN2Q9H4D0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLSTN2Q9H4D0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLSTN2Q9H4D0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLSTN2Q9H4D0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLSTN2Q9H4D0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLSTN2Q9H4D0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLSTN2Q9H4D0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLSTN2Q9H4D0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLSTN2Q9H4D0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms