Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T2

SEMA6C, Semaphorin-6C, humanhuman

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6CQ9H3T2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA6CQ9H3T2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA6CQ9H3T2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA6CQ9H3T2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA6CQ9H3T2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA6CQ9H3T2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA6CQ9H3T2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA6CQ9H3T2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA6CQ9H3T2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA6CQ9H3T2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA6CQ9H3T2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA6CQ9H3T2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA6CQ9H3T2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA6CQ9H3T2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA6CQ9H3T2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA6CQ9H3T2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA6CQ9H3T2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA6CQ9H3T2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA6CQ9H3T2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA6CQ9H3T2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA6CQ9H3T2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA6CQ9H3T2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA6CQ9H3T2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA6CQ9H3T2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA6CQ9H3T2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA6CQ9H3T2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA6CQ9H3T2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA6CQ9H3T2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA6CQ9H3T2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms