Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
KDM5DQ9BY66 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
KDM5DQ9BY66 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
KDM5DQ9BY66 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
KDM5DQ9BY66 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.67■■■■□ 3.46
KDM5DQ9BY66 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
KDM5DQ9BY66 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
KDM5DQ9BY66 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
KDM5DQ9BY66 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
KDM5DQ9BY66 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
KDM5DQ9BY66 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM5DQ9BY66 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM5DQ9BY66 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM5DQ9BY66 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM5DQ9BY66 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM5DQ9BY66 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM5DQ9BY66 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM5DQ9BY66 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM5DQ9BY66 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM5DQ9BY66 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM5DQ9BY66 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM5DQ9BY66 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
KDM5DQ9BY66 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
KDM5DQ9BY66 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM5DQ9BY66 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM5DQ9BY66 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM5DQ9BY66 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM5DQ9BY66 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM5DQ9BY66 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM5DQ9BY66 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM5DQ9BY66 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
KDM5DQ9BY66 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
KDM5DQ9BY66 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
KDM5DQ9BY66 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
KDM5DQ9BY66 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
KDM5DQ9BY66 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
KDM5DQ9BY66 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
KDM5DQ9BY66 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.56■■■■□ 3.44
KDM5DQ9BY66 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
KDM5DQ9BY66 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
KDM5DQ9BY66 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
KDM5DQ9BY66 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
KDM5DQ9BY66 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
KDM5DQ9BY66 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
KDM5DQ9BY66 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
KDM5DQ9BY66 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
KDM5DQ9BY66 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
KDM5DQ9BY66 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
KDM5DQ9BY66 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
KDM5DQ9BY66 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
KDM5DQ9BY66 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
KDM5DQ9BY66 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
KDM5DQ9BY66 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
KDM5DQ9BY66 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
KDM5DQ9BY66 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
KDM5DQ9BY66 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
KDM5DQ9BY66 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
KDM5DQ9BY66 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM5DQ9BY66 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM5DQ9BY66 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM5DQ9BY66 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
KDM5DQ9BY66 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM5DQ9BY66 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM5DQ9BY66 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM5DQ9BY66 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM5DQ9BY66 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM5DQ9BY66 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM5DQ9BY66 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
KDM5DQ9BY66 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM5DQ9BY66 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM5DQ9BY66 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM5DQ9BY66 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM5DQ9BY66 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM5DQ9BY66 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
KDM5DQ9BY66 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM5DQ9BY66 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
KDM5DQ9BY66 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
KDM5DQ9BY66 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms