Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SALL3Q9BXA9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SALL3Q9BXA9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SALL3Q9BXA9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SALL3Q9BXA9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SALL3Q9BXA9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SALL3Q9BXA9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SALL3Q9BXA9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SALL3Q9BXA9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SALL3Q9BXA9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SALL3Q9BXA9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SALL3Q9BXA9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SALL3Q9BXA9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SALL3Q9BXA9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SALL3Q9BXA9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SALL3Q9BXA9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SALL3Q9BXA9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SALL3Q9BXA9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SALL3Q9BXA9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SALL3Q9BXA9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SALL3Q9BXA9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SALL3Q9BXA9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SALL3Q9BXA9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SALL3Q9BXA9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SALL3Q9BXA9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SALL3Q9BXA9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SALL3Q9BXA9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SALL3Q9BXA9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SALL3Q9BXA9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SALL3Q9BXA9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SALL3Q9BXA9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SALL3Q9BXA9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SALL3Q9BXA9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SALL3Q9BXA9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SALL3Q9BXA9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SALL3Q9BXA9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SALL3Q9BXA9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SALL3Q9BXA9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SALL3Q9BXA9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SALL3Q9BXA9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SALL3Q9BXA9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SALL3Q9BXA9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SALL3Q9BXA9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SALL3Q9BXA9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SALL3Q9BXA9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SALL3Q9BXA9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SALL3Q9BXA9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SALL3Q9BXA9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SALL3Q9BXA9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SALL3Q9BXA9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SALL3Q9BXA9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SALL3Q9BXA9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SALL3Q9BXA9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SALL3Q9BXA9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SALL3Q9BXA9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SALL3Q9BXA9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SALL3Q9BXA9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SALL3Q9BXA9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SALL3Q9BXA9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SALL3Q9BXA9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SALL3Q9BXA9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SALL3Q9BXA9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms