Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HERC2P3Q9BVR0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERC2P3Q9BVR0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HERC2P3Q9BVR0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms