Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf50Q9BV19 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf50Q9BV19 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf50Q9BV19 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms