Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RSG1Q9BU20 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
RSG1Q9BU20 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RSG1Q9BU20 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms