Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSEN34Q9BSV6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSEN34Q9BSV6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSEN34Q9BSV6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSEN34Q9BSV6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSEN34Q9BSV6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TSEN34Q9BSV6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TSEN34Q9BSV6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSEN34Q9BSV6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSEN34Q9BSV6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSEN34Q9BSV6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSEN34Q9BSV6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSEN34Q9BSV6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSEN34Q9BSV6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSEN34Q9BSV6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSEN34Q9BSV6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSEN34Q9BSV6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSEN34Q9BSV6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSEN34Q9BSV6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSEN34Q9BSV6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSEN34Q9BSV6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSEN34Q9BSV6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSEN34Q9BSV6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSEN34Q9BSV6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSEN34Q9BSV6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSEN34Q9BSV6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSEN34Q9BSV6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TSEN34Q9BSV6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSEN34Q9BSV6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSEN34Q9BSV6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSEN34Q9BSV6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSEN34Q9BSV6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSEN34Q9BSV6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSEN34Q9BSV6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSEN34Q9BSV6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSEN34Q9BSV6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSEN34Q9BSV6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSEN34Q9BSV6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSEN34Q9BSV6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSEN34Q9BSV6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSEN34Q9BSV6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSEN34Q9BSV6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSEN34Q9BSV6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSEN34Q9BSV6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSEN34Q9BSV6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSEN34Q9BSV6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSEN34Q9BSV6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSEN34Q9BSV6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSEN34Q9BSV6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSEN34Q9BSV6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSEN34Q9BSV6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSEN34Q9BSV6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSEN34Q9BSV6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSEN34Q9BSV6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSEN34Q9BSV6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSEN34Q9BSV6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSEN34Q9BSV6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TSEN34Q9BSV6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TSEN34Q9BSV6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSEN34Q9BSV6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TSEN34Q9BSV6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSEN34Q9BSV6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSEN34Q9BSV6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSEN34Q9BSV6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSEN34Q9BSV6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSEN34Q9BSV6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSEN34Q9BSV6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TSEN34Q9BSV6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TSEN34Q9BSV6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSEN34Q9BSV6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSEN34Q9BSV6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSEN34Q9BSV6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSEN34Q9BSV6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSEN34Q9BSV6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSEN34Q9BSV6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSEN34Q9BSV6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 554.6 ms