Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MESP1Q9BRJ9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MESP1Q9BRJ9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MESP1Q9BRJ9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms