Protein–RNA interactions for Protein: Q99835

SMO, Smoothened homolog, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOQ99835 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMOQ99835 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMOQ99835 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMOQ99835 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMOQ99835 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMOQ99835 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMOQ99835 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMOQ99835 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMOQ99835 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMOQ99835 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMOQ99835 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMOQ99835 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMOQ99835 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMOQ99835 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMOQ99835 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMOQ99835 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMOQ99835 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMOQ99835 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMOQ99835 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SMOQ99835 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMOQ99835 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMOQ99835 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMOQ99835 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMOQ99835 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMOQ99835 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMOQ99835 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SMOQ99835 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SMOQ99835 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMOQ99835 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMOQ99835 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMOQ99835 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMOQ99835 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMOQ99835 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMOQ99835 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMOQ99835 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMOQ99835 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMOQ99835 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMOQ99835 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMOQ99835 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SMOQ99835 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SMOQ99835 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMOQ99835 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMOQ99835 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMOQ99835 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMOQ99835 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMOQ99835 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMOQ99835 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMOQ99835 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMOQ99835 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMOQ99835 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMOQ99835 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMOQ99835 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMOQ99835 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SMOQ99835 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMOQ99835 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMOQ99835 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMOQ99835 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMOQ99835 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMOQ99835 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMOQ99835 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMOQ99835 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SMOQ99835 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMOQ99835 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMOQ99835 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMOQ99835 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMOQ99835 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMOQ99835 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMOQ99835 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMOQ99835 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SMOQ99835 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMOQ99835 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMOQ99835 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMOQ99835 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMOQ99835 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMOQ99835 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMOQ99835 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMOQ99835 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMOQ99835 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMOQ99835 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMOQ99835 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMOQ99835 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SMOQ99835 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMOQ99835 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMOQ99835 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMOQ99835 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMOQ99835 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMOQ99835 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMOQ99835 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMOQ99835 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMOQ99835 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMOQ99835 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMOQ99835 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMOQ99835 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMOQ99835 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMOQ99835 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMOQ99835 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMOQ99835 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMOQ99835 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMOQ99835 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMOQ99835 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms