Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF558Q96NG5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF558Q96NG5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF558Q96NG5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF558Q96NG5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF558Q96NG5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF558Q96NG5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF558Q96NG5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF558Q96NG5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF558Q96NG5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF558Q96NG5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF558Q96NG5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF558Q96NG5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF558Q96NG5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF558Q96NG5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF558Q96NG5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF558Q96NG5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF558Q96NG5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF558Q96NG5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF558Q96NG5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF558Q96NG5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF558Q96NG5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF558Q96NG5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF558Q96NG5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF558Q96NG5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF558Q96NG5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF558Q96NG5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF558Q96NG5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF558Q96NG5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms