Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C8orf49Q96NF6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C8orf49Q96NF6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C8orf49Q96NF6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms