Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM71F1Q96KD3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM71F1Q96KD3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM71F1Q96KD3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms