Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
ABCC12Q96J65 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
ABCC12Q96J65 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ABCC12Q96J65 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ABCC12Q96J65 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCC12Q96J65 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms