Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC51Q96ER9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC51Q96ER9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC51Q96ER9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC51Q96ER9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC51Q96ER9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC51Q96ER9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC51Q96ER9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC51Q96ER9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC51Q96ER9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC51Q96ER9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC51Q96ER9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC51Q96ER9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC51Q96ER9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC51Q96ER9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC51Q96ER9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC51Q96ER9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC51Q96ER9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC51Q96ER9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC51Q96ER9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC51Q96ER9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC51Q96ER9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC51Q96ER9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC51Q96ER9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC51Q96ER9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC51Q96ER9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC51Q96ER9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC51Q96ER9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC51Q96ER9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC51Q96ER9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC51Q96ER9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC51Q96ER9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC51Q96ER9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC51Q96ER9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC51Q96ER9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC51Q96ER9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC51Q96ER9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC51Q96ER9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC51Q96ER9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC51Q96ER9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC51Q96ER9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC51Q96ER9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC51Q96ER9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC51Q96ER9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC51Q96ER9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC51Q96ER9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC51Q96ER9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC51Q96ER9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC51Q96ER9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC51Q96ER9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC51Q96ER9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC51Q96ER9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC51Q96ER9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC51Q96ER9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC51Q96ER9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC51Q96ER9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC51Q96ER9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC51Q96ER9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms