Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC126Q96EE4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC126Q96EE4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC126Q96EE4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC126Q96EE4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC126Q96EE4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC126Q96EE4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC126Q96EE4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC126Q96EE4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC126Q96EE4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC126Q96EE4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC126Q96EE4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC126Q96EE4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC126Q96EE4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC126Q96EE4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC126Q96EE4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC126Q96EE4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC126Q96EE4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC126Q96EE4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC126Q96EE4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC126Q96EE4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCDC126Q96EE4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC126Q96EE4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC126Q96EE4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC126Q96EE4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms