Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPDL1Q96EA4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPDL1Q96EA4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPDL1Q96EA4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms