Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAF2Q96CS3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FAF2Q96CS3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FAF2Q96CS3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAF2Q96CS3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms