Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCE1Q969G3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SMARCE1Q969G3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMARCE1Q969G3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCE1Q969G3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCE1Q969G3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCE1Q969G3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCE1Q969G3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCE1Q969G3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMARCE1Q969G3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCE1Q969G3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMARCE1Q969G3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCE1Q969G3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCE1Q969G3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCE1Q969G3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCE1Q969G3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMARCE1Q969G3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCE1Q969G3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCE1Q969G3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCE1Q969G3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCE1Q969G3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCE1Q969G3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCE1Q969G3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCE1Q969G3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCE1Q969G3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCE1Q969G3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCE1Q969G3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCE1Q969G3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCE1Q969G3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCE1Q969G3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMARCE1Q969G3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms