Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CELF1Q92879 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CELF1Q92879 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CELF1Q92879 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CELF1Q92879 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CELF1Q92879 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CELF1Q92879 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CELF1Q92879 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CELF1Q92879 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CELF1Q92879 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CELF1Q92879 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CELF1Q92879 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CELF1Q92879 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CELF1Q92879 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CELF1Q92879 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CELF1Q92879 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CELF1Q92879 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CELF1Q92879 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CELF1Q92879 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CELF1Q92879 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CELF1Q92879 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CELF1Q92879 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CELF1Q92879 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CELF1Q92879 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CELF1Q92879 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CELF1Q92879 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CELF1Q92879 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CELF1Q92879 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CELF1Q92879 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CELF1Q92879 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CELF1Q92879 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CELF1Q92879 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CELF1Q92879 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CELF1Q92879 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CELF1Q92879 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CELF1Q92879 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CELF1Q92879 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CELF1Q92879 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CELF1Q92879 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CELF1Q92879 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CELF1Q92879 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CELF1Q92879 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CELF1Q92879 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CELF1Q92879 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CELF1Q92879 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CELF1Q92879 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms