Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TSKUQ8WUA8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TSKUQ8WUA8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSKUQ8WUA8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms