Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP33Q8TEY7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
USP33Q8TEY7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP33Q8TEY7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP33Q8TEY7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP33Q8TEY7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP33Q8TEY7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP33Q8TEY7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP33Q8TEY7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP33Q8TEY7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP33Q8TEY7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP33Q8TEY7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP33Q8TEY7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP33Q8TEY7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP33Q8TEY7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP33Q8TEY7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP33Q8TEY7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP33Q8TEY7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP33Q8TEY7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP33Q8TEY7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP33Q8TEY7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USP33Q8TEY7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP33Q8TEY7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP33Q8TEY7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP33Q8TEY7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP33Q8TEY7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP33Q8TEY7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP33Q8TEY7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP33Q8TEY7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP33Q8TEY7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP33Q8TEY7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP33Q8TEY7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP33Q8TEY7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP33Q8TEY7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP33Q8TEY7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP33Q8TEY7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP33Q8TEY7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP33Q8TEY7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP33Q8TEY7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP33Q8TEY7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP33Q8TEY7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP33Q8TEY7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP33Q8TEY7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP33Q8TEY7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP33Q8TEY7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP33Q8TEY7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP33Q8TEY7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP33Q8TEY7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP33Q8TEY7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP33Q8TEY7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP33Q8TEY7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP33Q8TEY7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP33Q8TEY7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP33Q8TEY7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP33Q8TEY7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP33Q8TEY7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP33Q8TEY7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP33Q8TEY7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP33Q8TEY7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP33Q8TEY7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms