Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE04

PANK1, Pantothenate kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK1Q8TE04 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PANK1Q8TE04 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PANK1Q8TE04 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PANK1Q8TE04 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PANK1Q8TE04 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PANK1Q8TE04 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PANK1Q8TE04 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PANK1Q8TE04 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PANK1Q8TE04 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PANK1Q8TE04 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PANK1Q8TE04 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PANK1Q8TE04 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PANK1Q8TE04 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PANK1Q8TE04 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PANK1Q8TE04 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PANK1Q8TE04 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PANK1Q8TE04 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PANK1Q8TE04 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
PANK1Q8TE04 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PANK1Q8TE04 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PANK1Q8TE04 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PANK1Q8TE04 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PANK1Q8TE04 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PANK1Q8TE04 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PANK1Q8TE04 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PANK1Q8TE04 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PANK1Q8TE04 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PANK1Q8TE04 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PANK1Q8TE04 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PANK1Q8TE04 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PANK1Q8TE04 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PANK1Q8TE04 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PANK1Q8TE04 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PANK1Q8TE04 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
PANK1Q8TE04 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PANK1Q8TE04 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PANK1Q8TE04 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PANK1Q8TE04 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PANK1Q8TE04 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PANK1Q8TE04 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PANK1Q8TE04 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PANK1Q8TE04 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PANK1Q8TE04 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PANK1Q8TE04 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PANK1Q8TE04 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PANK1Q8TE04 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PANK1Q8TE04 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PANK1Q8TE04 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PANK1Q8TE04 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PANK1Q8TE04 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PANK1Q8TE04 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PANK1Q8TE04 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PANK1Q8TE04 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PANK1Q8TE04 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PANK1Q8TE04 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PANK1Q8TE04 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PANK1Q8TE04 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PANK1Q8TE04 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PANK1Q8TE04 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PANK1Q8TE04 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PANK1Q8TE04 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.4 ms