Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HAVCR2Q8TDQ0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HAVCR2Q8TDQ0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HAVCR2Q8TDQ0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms