Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC99

FNDC8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC8Q8TC99 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FNDC8Q8TC99 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNDC8Q8TC99 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC8Q8TC99 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms