Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMG8Q8ND04 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMG8Q8ND04 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMG8Q8ND04 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMG8Q8ND04 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMG8Q8ND04 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMG8Q8ND04 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMG8Q8ND04 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMG8Q8ND04 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMG8Q8ND04 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMG8Q8ND04 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMG8Q8ND04 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMG8Q8ND04 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMG8Q8ND04 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SMG8Q8ND04 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMG8Q8ND04 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMG8Q8ND04 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMG8Q8ND04 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMG8Q8ND04 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMG8Q8ND04 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMG8Q8ND04 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMG8Q8ND04 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMG8Q8ND04 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMG8Q8ND04 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMG8Q8ND04 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SMG8Q8ND04 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMG8Q8ND04 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMG8Q8ND04 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMG8Q8ND04 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMG8Q8ND04 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMG8Q8ND04 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMG8Q8ND04 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SMG8Q8ND04 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMG8Q8ND04 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMG8Q8ND04 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMG8Q8ND04 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SMG8Q8ND04 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMG8Q8ND04 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMG8Q8ND04 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMG8Q8ND04 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMG8Q8ND04 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMG8Q8ND04 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMG8Q8ND04 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMG8Q8ND04 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SMG8Q8ND04 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SMG8Q8ND04 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMG8Q8ND04 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMG8Q8ND04 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMG8Q8ND04 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SMG8Q8ND04 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SMG8Q8ND04 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMG8Q8ND04 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMG8Q8ND04 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMG8Q8ND04 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMG8Q8ND04 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SMG8Q8ND04 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMG8Q8ND04 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMG8Q8ND04 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMG8Q8ND04 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMG8Q8ND04 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms