Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAU1

FNDC5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC5Q8NAU1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC5Q8NAU1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC5Q8NAU1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC5Q8NAU1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC5Q8NAU1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNDC5Q8NAU1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC5Q8NAU1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNDC5Q8NAU1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC5Q8NAU1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC5Q8NAU1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC5Q8NAU1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC5Q8NAU1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC5Q8NAU1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC5Q8NAU1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC5Q8NAU1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNDC5Q8NAU1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC5Q8NAU1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC5Q8NAU1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC5Q8NAU1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC5Q8NAU1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC5Q8NAU1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC5Q8NAU1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC5Q8NAU1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNDC5Q8NAU1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FNDC5Q8NAU1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FNDC5Q8NAU1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms