Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC89Q8N998 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC89Q8N998 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC89Q8N998 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms