Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LINC00612Q8N6U2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00612Q8N6U2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00612Q8N6U2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00612Q8N6U2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms