Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDDC3Q8N4P3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDDC3Q8N4P3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDDC3Q8N4P3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDDC3Q8N4P3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HDDC3Q8N4P3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDDC3Q8N4P3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HDDC3Q8N4P3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDDC3Q8N4P3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HDDC3Q8N4P3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDDC3Q8N4P3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDDC3Q8N4P3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDDC3Q8N4P3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDDC3Q8N4P3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDDC3Q8N4P3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDDC3Q8N4P3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HDDC3Q8N4P3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDDC3Q8N4P3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDDC3Q8N4P3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDDC3Q8N4P3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDDC3Q8N4P3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDDC3Q8N4P3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDDC3Q8N4P3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDDC3Q8N4P3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDDC3Q8N4P3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HDDC3Q8N4P3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDDC3Q8N4P3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDDC3Q8N4P3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDDC3Q8N4P3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDDC3Q8N4P3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDDC3Q8N4P3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDDC3Q8N4P3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDDC3Q8N4P3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HDDC3Q8N4P3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HDDC3Q8N4P3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDDC3Q8N4P3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HDDC3Q8N4P3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
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