Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC43Q8N309 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC43Q8N309 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC43Q8N309 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC43Q8N309 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms