Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARCQ7LC44 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARCQ7LC44 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARCQ7LC44 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARCQ7LC44 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARCQ7LC44 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARCQ7LC44 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARCQ7LC44 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARCQ7LC44 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARCQ7LC44 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARCQ7LC44 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ARCQ7LC44 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARCQ7LC44 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARCQ7LC44 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARCQ7LC44 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARCQ7LC44 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms