Protein–RNA interactions for Protein: Q6XE38

SCGB1D4, Secretoglobin family 1D member 4, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB1D4Q6XE38 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCGB1D4Q6XE38 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCGB1D4Q6XE38 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCGB1D4Q6XE38 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCGB1D4Q6XE38 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCGB1D4Q6XE38 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCGB1D4Q6XE38 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCGB1D4Q6XE38 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCGB1D4Q6XE38 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCGB1D4Q6XE38 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCGB1D4Q6XE38 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCGB1D4Q6XE38 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCGB1D4Q6XE38 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCGB1D4Q6XE38 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCGB1D4Q6XE38 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCGB1D4Q6XE38 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCGB1D4Q6XE38 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCGB1D4Q6XE38 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCGB1D4Q6XE38 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SCGB1D4Q6XE38 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCGB1D4Q6XE38 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCGB1D4Q6XE38 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCGB1D4Q6XE38 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SCGB1D4Q6XE38 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCGB1D4Q6XE38 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SCGB1D4Q6XE38 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms