Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSSK4Q6SA08 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSSK4Q6SA08 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSSK4Q6SA08 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSSK4Q6SA08 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TSSK4Q6SA08 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TSSK4Q6SA08 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSSK4Q6SA08 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TSSK4Q6SA08 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms