Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MED27Q6P2C8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED27Q6P2C8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED27Q6P2C8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms