Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPANXN1Q5VSR9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPANXN1Q5VSR9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPANXN1Q5VSR9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPANXN1Q5VSR9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SPANXN1Q5VSR9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SPANXN1Q5VSR9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms