Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUD3Q5T2D3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD3Q5T2D3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD3Q5T2D3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.1 ms