Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NEXMIFQ5QGS0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NEXMIFQ5QGS0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NEXMIFQ5QGS0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NEXMIFQ5QGS0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NEXMIFQ5QGS0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
NEXMIFQ5QGS0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
NEXMIFQ5QGS0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NEXMIFQ5QGS0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NEXMIFQ5QGS0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
NEXMIFQ5QGS0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NEXMIFQ5QGS0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NEXMIFQ5QGS0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NEXMIFQ5QGS0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEXMIFQ5QGS0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEXMIFQ5QGS0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEXMIFQ5QGS0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEXMIFQ5QGS0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEXMIFQ5QGS0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEXMIFQ5QGS0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
NEXMIFQ5QGS0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NEXMIFQ5QGS0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NEXMIFQ5QGS0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
NEXMIFQ5QGS0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NEXMIFQ5QGS0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NEXMIFQ5QGS0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NEXMIFQ5QGS0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.22
NEXMIFQ5QGS0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
NEXMIFQ5QGS0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NEXMIFQ5QGS0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NEXMIFQ5QGS0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NEXMIFQ5QGS0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NEXMIFQ5QGS0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NEXMIFQ5QGS0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NEXMIFQ5QGS0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NEXMIFQ5QGS0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NEXMIFQ5QGS0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NEXMIFQ5QGS0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NEXMIFQ5QGS0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NEXMIFQ5QGS0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NEXMIFQ5QGS0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NEXMIFQ5QGS0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NEXMIFQ5QGS0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NEXMIFQ5QGS0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NEXMIFQ5QGS0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
NEXMIFQ5QGS0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
NEXMIFQ5QGS0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
NEXMIFQ5QGS0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NEXMIFQ5QGS0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NEXMIFQ5QGS0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NEXMIFQ5QGS0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NEXMIFQ5QGS0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NEXMIFQ5QGS0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
NEXMIFQ5QGS0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NEXMIFQ5QGS0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NEXMIFQ5QGS0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NEXMIFQ5QGS0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NEXMIFQ5QGS0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
NEXMIFQ5QGS0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NEXMIFQ5QGS0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NEXMIFQ5QGS0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
NEXMIFQ5QGS0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NEXMIFQ5QGS0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NEXMIFQ5QGS0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
NEXMIFQ5QGS0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NEXMIFQ5QGS0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NEXMIFQ5QGS0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NEXMIFQ5QGS0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NEXMIFQ5QGS0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NEXMIFQ5QGS0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NEXMIFQ5QGS0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NEXMIFQ5QGS0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NEXMIFQ5QGS0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NEXMIFQ5QGS0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NEXMIFQ5QGS0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
NEXMIFQ5QGS0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NEXMIFQ5QGS0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
NEXMIFQ5QGS0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
NEXMIFQ5QGS0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NEXMIFQ5QGS0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
NEXMIFQ5QGS0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC35■■■■□ 3.19
NEXMIFQ5QGS0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
NEXMIFQ5QGS0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
NEXMIFQ5QGS0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NEXMIFQ5QGS0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NEXMIFQ5QGS0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NEXMIFQ5QGS0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NEXMIFQ5QGS0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NEXMIFQ5QGS0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NEXMIFQ5QGS0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NEXMIFQ5QGS0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NEXMIFQ5QGS0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
NEXMIFQ5QGS0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NEXMIFQ5QGS0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NEXMIFQ5QGS0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NEXMIFQ5QGS0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NEXMIFQ5QGS0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NEXMIFQ5QGS0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NEXMIFQ5QGS0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NEXMIFQ5QGS0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms