Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAPPA-AS1Q5QFB9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAPPA-AS1Q5QFB9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PAPPA-AS1Q5QFB9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAPPA-AS1Q5QFB9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PAPPA-AS1Q5QFB9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAPPA-AS1Q5QFB9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PAPPA-AS1Q5QFB9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAPPA-AS1Q5QFB9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAPPA-AS1Q5QFB9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAPPA-AS1Q5QFB9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAPPA-AS1Q5QFB9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PAPPA-AS1Q5QFB9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAPPA-AS1Q5QFB9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAPPA-AS1Q5QFB9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAPPA-AS1Q5QFB9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAPPA-AS1Q5QFB9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PAPPA-AS1Q5QFB9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAPPA-AS1Q5QFB9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PAPPA-AS1Q5QFB9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PAPPA-AS1Q5QFB9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms