Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPANXN4Q5MJ08 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPANXN4Q5MJ08 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPANXN4Q5MJ08 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms