Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH70

XKR9, XK-related protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR9Q5GH70 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XKR9Q5GH70 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
XKR9Q5GH70 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
XKR9Q5GH70 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XKR9Q5GH70 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XKR9Q5GH70 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
XKR9Q5GH70 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
XKR9Q5GH70 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
XKR9Q5GH70 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
XKR9Q5GH70 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
XKR9Q5GH70 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
XKR9Q5GH70 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
XKR9Q5GH70 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
XKR9Q5GH70 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
XKR9Q5GH70 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
XKR9Q5GH70 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
XKR9Q5GH70 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
XKR9Q5GH70 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
XKR9Q5GH70 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
XKR9Q5GH70 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
XKR9Q5GH70 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
XKR9Q5GH70 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XKR9Q5GH70 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XKR9Q5GH70 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
XKR9Q5GH70 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
XKR9Q5GH70 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
XKR9Q5GH70 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
XKR9Q5GH70 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
XKR9Q5GH70 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XKR9Q5GH70 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
XKR9Q5GH70 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
XKR9Q5GH70 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
XKR9Q5GH70 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
XKR9Q5GH70 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms