Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC142Q17RM4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC142Q17RM4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC142Q17RM4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
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