Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RTL8BQ17RB0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RTL8BQ17RB0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RTL8BQ17RB0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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