Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDK4Q16654 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDK4Q16654 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDK4Q16654 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
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