Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
E2F4Q16254 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
E2F4Q16254 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
E2F4Q16254 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
E2F4Q16254 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
E2F4Q16254 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
E2F4Q16254 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
E2F4Q16254 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
E2F4Q16254 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
E2F4Q16254 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
E2F4Q16254 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
E2F4Q16254 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
E2F4Q16254 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
E2F4Q16254 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
E2F4Q16254 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
E2F4Q16254 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
E2F4Q16254 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
E2F4Q16254 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
E2F4Q16254 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
E2F4Q16254 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
E2F4Q16254 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
E2F4Q16254 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
E2F4Q16254 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
E2F4Q16254 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
E2F4Q16254 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
E2F4Q16254 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms