Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNCBQ16143 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNCBQ16143 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNCBQ16143 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNCBQ16143 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
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