Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPAQ15257 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPAQ15257 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPAQ15257 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPAQ15257 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPAQ15257 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPAQ15257 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPAQ15257 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPAQ15257 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPAQ15257 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPAQ15257 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPAQ15257 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PTPAQ15257 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPAQ15257 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPAQ15257 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPAQ15257 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPAQ15257 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPAQ15257 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPAQ15257 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPAQ15257 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPAQ15257 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPAQ15257 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPAQ15257 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPAQ15257 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPAQ15257 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPAQ15257 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPAQ15257 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPAQ15257 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPAQ15257 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPAQ15257 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPAQ15257 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPAQ15257 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPAQ15257 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPAQ15257 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPAQ15257 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPAQ15257 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPAQ15257 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPAQ15257 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPAQ15257 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPAQ15257 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPAQ15257 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPAQ15257 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPAQ15257 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPAQ15257 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPAQ15257 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPAQ15257 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPAQ15257 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPAQ15257 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPAQ15257 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPAQ15257 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPAQ15257 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
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PTPAQ15257 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPAQ15257 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
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PTPAQ15257 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPAQ15257 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPAQ15257 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
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PTPAQ15257 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPAQ15257 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPAQ15257 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPAQ15257 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
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PTPAQ15257 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPAQ15257 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPAQ15257 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPAQ15257 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPAQ15257 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPAQ15257 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPAQ15257 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPAQ15257 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPAQ15257 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPAQ15257 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPAQ15257 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPAQ15257 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPAQ15257 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPAQ15257 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPAQ15257 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPAQ15257 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPAQ15257 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPAQ15257 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPAQ15257 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPAQ15257 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPAQ15257 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPAQ15257 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPAQ15257 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPAQ15257 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPAQ15257 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPAQ15257 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPAQ15257 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPAQ15257 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPAQ15257 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPAQ15257 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPAQ15257 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPAQ15257 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
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