Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPTAN1Q13813 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPTAN1Q13813 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPTAN1Q13813 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPTAN1Q13813 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPTAN1Q13813 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPTAN1Q13813 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPTAN1Q13813 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPTAN1Q13813 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPTAN1Q13813 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPTAN1Q13813 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPTAN1Q13813 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SPTAN1Q13813 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPTAN1Q13813 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPTAN1Q13813 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPTAN1Q13813 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPTAN1Q13813 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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