Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1orf61Q13536 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
C1orf61Q13536 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1orf61Q13536 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1orf61Q13536 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
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